Chalkidiki hat eine reiche historische Vergangenheit. In der Höhle von Petralona wurden Funde gemacht, die auf 700.000 Jahre datiert werden. In Stagira wurde der Philosoph Aristoteles geboren, Lehrer von Alexander dem Großen.

Kassandra ist benannt nach dem makedonischen König Kassandros, Sithonia nach Sithon, dem Sohn von Neptun, und Athos nach dem mythischen Riesen Athos.

Im 9. Jahrhundert wurde die erste klösterliche Gemeinschaft auf dem Athos gegründet und heute bildet der größte Teil von Athos die Mönchsrepublik Agios Oros.